交通运输已经形成初具规模的陆、水、空和地下管道运输并行的综合运输网。目前，拥有哈长、滨绥、滨洲等60条铁路干线、支线和联络线，是全国铁路密度较高的地区之一。公路现有国道8条，省道20条。航空运输业发展很快，拥有哈尔滨、齐齐哈尔、牡丹江、佳木斯、黑河等5个机场，航空线路67条。黑龙江水系是中国三大通航水系之一，主要干流有黑龙江、松花江、嫩江、乌苏里江等，共有港口、码头331个，全年吞吐能力达1200万吨。在此基础上，黑龙江省近期又加大基础设施建设力度，确保完成京哈、哈绥、鹤佳3条高速公路和伊鹤等6条高等级公路续建工程，北黑铁路、黑河机场改造、扩建工程也正在加紧进行。